MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 plasmid pSHaeC

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007171	GAA	2	6	11	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007171	TTAA	2	8	20	27	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007171	CGA	2	6	35	40	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007171	CGA	2	6	68	73	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007171	TTA	2	6	91	96	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007171	AAT	2	6	132	137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007171	TTA	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007171	ACCA	2	8	168	175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007171	A	6	6	177	182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007171	TGGT	2	8	183	190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007171	T	6	6	201	206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007171	T	6	6	444	449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007171	TA	3	6	453	458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007171	ATT	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007171	GAG	2	6	530	535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007171	AGT	2	6	556	561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535051
17	NC_007171	TAA	2	6	637	642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535051
18	NC_007171	TTA	2	6	732	737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535051
19	NC_007171	CTTAA	2	10	767	776	40 %	40 %	0 %	20 %	68535051
20	NC_007171	TA	3	6	779	784	50 %	50 %	0 %	0 %	68535051
21	NC_007171	ATTT	2	8	811	818	25 %	75 %	0 %	0 %	68535051
22	NC_007171	GAA	2	6	848	853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535051
23	NC_007171	GAT	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535051
24	NC_007171	ATGA	2	8	1067	1074	50 %	25 %	25 %	0 %	68535051
25	NC_007171	AAT	2	6	1099	1104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535051
26	NC_007171	AAT	2	6	1127	1132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535051
27	NC_007171	A	6	6	1157	1162	100 %	0 %	0 %	0 %	68535051
28	NC_007171	CCCAA	2	10	1248	1257	40 %	0 %	0 %	60 %	68535051
29	NC_007171	AT	3	6	1261	1266	50 %	50 %	0 %	0 %	68535051
30	NC_007171	AGA	3	9	1333	1341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535051
31	NC_007171	AAC	3	9	1359	1367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535051
32	NC_007171	ACA	2	6	1378	1383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535051
33	NC_007171	AACA	2	8	1448	1455	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007171	CAT	2	6	1464	1469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007171	T	6	6	1518	1523	0 %	100 %	0 %	0 %	68535052
36	NC_007171	TAA	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535052
37	NC_007171	CAA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535052
38	NC_007171	AACA	2	8	1594	1601	75 %	0 %	0 %	25 %	68535052
39	NC_007171	CCT	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	68535053
40	NC_007171	TATAA	2	10	1657	1666	60 %	40 %	0 %	0 %	68535053
41	NC_007171	A	6	6	1699	1704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007171	ATG	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007171	TAAT	2	8	1920	1927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007171	TTA	2	6	1993	1998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535054
45	NC_007171	TAT	3	9	2037	2045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535054
46	NC_007171	ATA	2	6	2070	2075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
47	NC_007171	AAT	2	6	2083	2088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
48	NC_007171	CAAT	2	8	2102	2109	50 %	25 %	0 %	25 %	68535054
49	NC_007171	TA	3	6	2130	2135	50 %	50 %	0 %	0 %	68535054
50	NC_007171	AAC	2	6	2217	2222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535054
51	NC_007171	CAA	2	6	2225	2230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535054
52	NC_007171	A	7	7	2229	2235	100 %	0 %	0 %	0 %	68535054
53	NC_007171	ATA	2	6	2248	2253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
54	NC_007171	ATT	2	6	2263	2268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535054
55	NC_007171	ATA	2	6	2294	2299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
56	NC_007171	T	6	6	2355	2360	0 %	100 %	0 %	0 %	68535054
57	NC_007171	T	7	7	2366	2372	0 %	100 %	0 %	0 %	68535054
58	NC_007171	TAC	2	6	2381	2386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535054
59	NC_007171	ATA	2	6	2417	2422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
60	NC_007171	TTATA	2	10	2441	2450	40 %	60 %	0 %	0 %	68535054
61	NC_007171	GTAG	2	8	2467	2474	25 %	25 %	50 %	0 %	68535054
62	NC_007171	A	6	6	2499	2504	100 %	0 %	0 %	0 %	68535054
63	NC_007171	TAA	2	6	2531	2536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
64	NC_007171	TTCA	2	8	2559	2566	25 %	50 %	0 %	25 %	68535054
65	NC_007171	TAA	3	9	2621	2629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
66	NC_007171	ATA	2	6	2633	2638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
67	NC_007171	ATA	2	6	2647	2652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
68	NC_007171	A	6	6	2656	2661	100 %	0 %	0 %	0 %	68535054
69	NC_007171	TA	3	6	2673	2678	50 %	50 %	0 %	0 %	68535054
70	NC_007171	TAC	3	9	2696	2704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535054
71	NC_007171	AAT	2	6	2845	2850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
72	NC_007171	CAAA	2	8	2861	2868	75 %	0 %	0 %	25 %	68535054
73	NC_007171	ATT	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535054
74	NC_007171	CA	3	6	2888	2893	50 %	0 %	0 %	50 %	68535054
75	NC_007171	T	7	7	2937	2943	0 %	100 %	0 %	0 %	68535054
76	NC_007171	TATAAA	2	12	2994	3005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535054
77	NC_007171	TA	4	8	3077	3084	50 %	50 %	0 %	0 %	68535054
78	NC_007171	A	6	6	3102	3107	100 %	0 %	0 %	0 %	68535054
79	NC_007171	CTT	3	9	3168	3176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
80	NC_007171	T	7	7	3175	3181	0 %	100 %	0 %	0 %	68535055
81	NC_007171	TCA	2	6	3185	3190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535055
82	NC_007171	CTT	2	6	3194	3199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
83	NC_007171	TCA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535055
84	NC_007171	CTT	2	6	3252	3257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
85	NC_007171	T	7	7	3262	3268	0 %	100 %	0 %	0 %	68535055
86	NC_007171	T	6	6	3274	3279	0 %	100 %	0 %	0 %	68535055
87	NC_007171	ATC	2	6	3286	3291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535055
88	NC_007171	AAAG	2	8	3299	3306	75 %	0 %	25 %	0 %	68535055
89	NC_007171	TAA	2	6	3332	3337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535055
90	NC_007171	ATT	2	6	3358	3363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535055
91	NC_007171	ACT	2	6	3371	3376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535055
92	NC_007171	CTG	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68535055
93	NC_007171	TTC	2	6	3436	3441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
94	NC_007171	TTA	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535055
95	NC_007171	TATGA	2	10	3487	3496	40 %	40 %	20 %	0 %	68535055
96	NC_007171	TCT	2	6	3544	3549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535055
97	NC_007171	TTG	2	6	3580	3585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68535055
98	NC_007171	T	8	8	3601	3608	0 %	100 %	0 %	0 %	68535055
99	NC_007171	TC	4	8	3623	3630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007171	TGT	2	6	3634	3639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007171	ATT	2	6	3655	3660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007171	T	7	7	3672	3678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007171	TA	3	6	3700	3705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007171	AGGG	2	8	3762	3769	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007171	A	6	6	3804	3809	100 %	0 %	0 %	0 %	68535056
106	NC_007171	A	7	7	3831	3837	100 %	0 %	0 %	0 %	68535056
107	NC_007171	AAGT	2	8	3867	3874	50 %	25 %	25 %	0 %	68535056
108	NC_007171	AAGA	2	8	3891	3898	75 %	0 %	25 %	0 %	68535056
109	NC_007171	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535056
110	NC_007171	GAA	2	6	3952	3957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535056
111	NC_007171	TCT	2	6	3991	3996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	68535056
112	NC_007171	TAA	2	6	4068	4073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535056
113	NC_007171	ATA	2	6	4115	4120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535056
114	NC_007171	TAT	2	6	4123	4128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535056
115	NC_007171	AT	4	8	4133	4140	50 %	50 %	0 %	0 %	68535056
116	NC_007171	GTT	2	6	4187	4192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	68535056
117	NC_007171	CAAAG	2	10	4216	4225	60 %	0 %	20 %	20 %	68535056
118	NC_007171	A	6	6	4227	4232	100 %	0 %	0 %	0 %	68535056
119	NC_007171	TGA	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535056
120	NC_007171	GCA	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68535056
121	NC_007171	TAAT	2	8	4328	4335	50 %	50 %	0 %	0 %	68535056
122	NC_007171	ATGA	2	8	4414	4421	50 %	25 %	25 %	0 %	68535056
123	NC_007171	TATAT	2	10	4432	4441	40 %	60 %	0 %	0 %	68535056
124	NC_007171	AAAT	2	8	4503	4510	75 %	25 %	0 %	0 %	68535057
125	NC_007171	T	6	6	4529	4534	0 %	100 %	0 %	0 %	68535057
126	NC_007171	AAC	2	6	4619	4624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	68535057
127	NC_007171	ACT	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	68535057
128	NC_007171	AAAG	2	8	4720	4727	75 %	0 %	25 %	0 %	68535057
129	NC_007171	ATA	2	6	4794	4799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535057
130	NC_007171	A	6	6	4820	4825	100 %	0 %	0 %	0 %	68535057
131	NC_007171	AGA	2	6	4900	4905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535057
132	NC_007171	A	6	6	4911	4916	100 %	0 %	0 %	0 %	68535057
133	NC_007171	TGA	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	68535057
134	NC_007171	AGA	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	68535057
135	NC_007171	AG	3	6	5038	5043	50 %	0 %	50 %	0 %	68535057
136	NC_007171	TAA	2	6	5053	5058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	68535057
137	NC_007171	GAC	2	6	5060	5065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	68535057
138	NC_007171	CTTTAA	2	12	5130	5141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	68535057
139	NC_007171	TTA	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535057
140	NC_007171	TTAT	2	8	5185	5192	25 %	75 %	0 %	0 %	68535057
141	NC_007171	CCAA	2	8	5214	5221	50 %	0 %	0 %	50 %	68535057
142	NC_007171	ATT	2	6	5248	5253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	68535057
143	NC_007171	TATG	2	8	5370	5377	25 %	50 %	25 %	0 %	68535057
144	NC_007171	TGC	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	68535057
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.